自然人既开了个体工商户，又在其他公司受雇取得工资薪金，这种情况下是否可以分开扣除6万元？

答：根据中国个人所得税法及相关规定，自然人在同时取得个体工商户经营所得和其他公司工资薪金所得（属于综合所得）的情况下，6万元的基本减除费用不得重复扣除，只能选择在综合所得或经营所得中一方扣除。具体分析如下：

1. 法律依据与核心规则

经营所得与综合所得的分类 

个体工商户的经营所得属于“经营所得”类别，而工资薪金属于“综合所得”类别。两者在计算个人所得税时适用不同的扣除规则。

基本减除费用不得重复扣除

    依据《个人所得税法实施条例》第十五条规定，若纳税人同时存在综合所得和经营所得，6万元的基本减除费用仅能在其中一方扣除，不得重复适用。例如：

    - 若在综合所得中已扣除6万元，则经营所得计算时不得再扣除。

    - 反之，若在经营所得中扣除6万元，则综合所得需全额计税。

2. 税务处理方式

• 申报时的选择权

   

纳税人需在年度汇算清缴时确定扣除方式。例如：

    - 若个体工商户的经营所得较高，可选择在经营所得中扣除6万元，而综合所得不再扣除。

    - 若工资薪金收入较高，则优先在综合所得中扣除，经营所得全额计税。

• 专项附加扣除的适用 

   

专项附加扣除（如子女教育、房贷利息等）可在综合所得或经营所得中任选一方扣除，但同样不能重复扣除。

3. 个体工商户的特殊规定

业主工资不得税前扣除

个体工商户业主的工资薪金支出不得作为成本在经营所得中扣除，但可通过6万元基本减除费用覆盖。从业人员的合理工资薪金支出则允许扣除。

4. 违规后果

重复扣除6万元将导致少缴税款，税务机关会要求补缴税款及滞纳金，甚至可能面临罚款。

所以，自然人同时取得个体工商户经营所得和工资薪金所得时，6万元的基本减除费用仅能选择在一方扣除，不可分开使用。纳税人需根据自身收入结构合理选择扣除方式，并在汇算清缴时完成税务调整。

以下内容参考阅读

• 《中华人民共和国个人所得税法》

• 《中华人民共和国个人所得税法实施条例》

• 《个人所得税综合所得汇算清缴管理办法》

• 《国家税务总局个体工商户个人所得税计税办法》