?请教下，创投类股权合伙企业，涉及单一基金备案有问题的，需要补缴税金，这个合伙企业是扣缴义务人还是纳税人，我们理解不一致，因涉及滞纳金，所以请教下。
关于个人合伙人对来源于创投企业的所得，计算个人所得税应纳税额，选择按单一投资基金核算或者按创投企业年度所得整体核算的税务处理问题，在2019年1月10日，财政部 税务总局 发展改革委 证监会就联合发布了《关于创业投资企业个人合伙人所得税政策问题的通知》（财税〔2019〕8号）。执行期限止2023年12月31日。
2023年8月21日，《关于延续实施创业投资企业个人合伙人所得税政策的公告》（财政部 税务总局 国家发展改革委 中国证监会公告2023年第24号）发布，延续了上述政策。执行期限至2027年12月31日
创投企业可以选择按单一投资基金核算或者按创投企业年度所得整体核算两种方式之一，对其个人合伙人来源于创投企业的所得计算个人所得税应纳税额。
创投企业选择按单一投资基金核算的，其个人合伙人从该基金应分得的股权转让所得和股息红利所得，按照20%税率计算缴纳个人所得税。
创投企业选择按年度所得整体核算的，其个人合伙人应从创投企业取得的所得，按照“经营所得”项目、5%—35%的超额累进税率计算缴纳个人所得税。
1. 本公告所称创投企业，是指符合《创业投资企业管理暂行办法》（发展改革委等10部门令第39号）或者《私募投资基金监督管理暂行办法》（证监会令第105号）关于创业投资企业（基金）的有关规定，并按照上述规定完成备案且规范运作的合伙制创业投资企业（基金）。
2. 单一投资基金核算，是指单一投资基金（包括不以基金名义设立的创投企业）在一个纳税年度内从不同创业投资项目取得的股权转让所得和股息红利所得按下述方法分别核算纳税：
（一）股权转让所得。单个投资项目的股权转让所得，按年度股权转让收入扣除对应股权原值和转让环节合理费用后的余额计算，股权原值和转让环节合理费用的确定方法，参照股权转让所得个人所得税有关政策规定执行；单一投资基金的股权转让所得，按一个纳税年度内不同投资项目的所得和损失相互抵减后的余额计算，余额大于或等于零的，即确认为该基金的年度股权转让所得；余额小于零的，该基金年度股权转让所得按零计算且不能跨年结转。
（二）股息红利所得。单一投资基金的股息红利所得，以其来源于所投资项目分配的股息、红利收入以及其他固定收益类证券等收入的全额计算。
注：除前述可以扣除的成本、费用之外，单一投资基金发生的包括投资基金管理人的管理费和业绩报酬在内的其他支出，不得在核算时扣除。
3. 创投企业年度所得整体核算，是指将创投企业以每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后，计算应分配给个人合伙人的所得。如符合《财政部 税务总局关于创业投资企业和天使投资个人有关税收政策的通知》（财税〔2018〕55号）规定条件的，创投企业个人合伙人可以按照被转让项目对应投资额的70%抵扣其可以从创投企业应分得的经营所得后再计算其应纳税额。年度核算亏损的，准予按有关规定向以后年度结转。
按照“经营所得”项目计税的个人合伙人，没有综合所得的，可依法减除基本减除费用、专项扣除、专项附加扣除以及国务院确定的其他扣除。从多处取得经营所得的，应汇总计算个人所得税，只减除一次上述费用和扣除。
从上述规定看，单一投资基金核算与年度所得整体核算，区别主要是：合伙企业的经营所得，其中的转让股权所得，个人合伙人应分得的部分，适用应税所得项目与税率不同；
2. 符合条件，对应投资额的70%，被抵扣对象不同：前者是个人合伙人应分得的“股权转让所得”。后者是个人合伙人应分得的“经营所得”。
1. 个人合伙人按照其应从基金年度股权转让所得中分得的份额计算其应纳税额，并由创投企业在次年3月31日前代扣代缴个人所得税。如符合《财政部 税务总局关于创业投资企业和天使投资个人有关税收政策的通知》（财税〔2018〕55号）规定条件的，创投企业个人合伙人可以按照被转让项目对应投资额的70%抵扣其应从基金年度股权转让所得中分得的份额后再计算其应纳税额，当期不足抵扣的，不得向以后年度结转。
2. 个人合伙人按照其应从基金股息红利所得中分得的份额计算其应纳税额，并由创投企业按次代扣代缴个人所得税。
3. 本条规定的单一投资基金核算方法仅适用于计算创投企业个人合伙人的应纳税额。
4.创投企业选择按单一投资基金核算或按创投企业年度所得整体核算后，3年内不能变更。
5.创投企业选择按单一投资基金核算的，应当在按照本公告第一条规定完成备案的30日内，向主管税务机关进行核算方式备案；未按规定备案的，视同选择按创投企业年度所得整体核算。创投企业选择一种核算方式满3年需要调整的，应当在满3年的次年1月31日前，重新向主管税务机关备案。
从上可知，创投企业应代扣代缴个人所得税的，是个人合伙人应从基金分得的股息红利所得。以及应分得的年度股权转让所得。
留言问题中，企业不符合单一基金备案的要求，被税务稽查发现，那作为一般的股权投资合伙企业转让其持有的股权，取得的所得，是合伙企业的经营所得。个人合伙人应分得的，应该按照“经营所得”项目，适用5%—35%的超额累进税率计算缴纳个人所得税。
如果合伙企业已经按照20%比例税率代扣代缴了个税，则要补缴税款。这里的规则：
1. 个人合伙人按照“经营所得”项目，适用5%—35%的超额累进税率计算缴纳个人所得税；
2. 合伙企业不是所得税的纳税义务人，也不是经营所得个税的法定扣缴义务人（经营所得，无法定扣缴义务人），但是可以代办申报。
3.合伙企业对个人合伙人应分得的股息红利所得，按次代扣代缴个人所得税，税率是20%。
