利用非营利组织的税务筹划关键在于充分利用其非营利组织的免税优势，具有免税资格的非营利组织取得会费收入、捐赠收入、政府补助收入都免征企业所得税。申请免税资格条件不难满足，注意支出与该组织有关且合理、工作人员工资福利要合理。

非营利组织也需要单独建账核算，清晰核算收入对应的成本、费用、损失。由于其收入免征企业所得税，成本费用即使无法取得发票，也不会增加税负。对于无票支出部分，可以凭合同、付款凭证以及其他证明文件入账。

依据：《企业所得税法》、《企业所得税法实施条例》、财税〔2009〕122号、财税〔2018〕13号

非营利组织从事营利性活动取得的收入需要按规定征税，增值税上可以选择按照小规模纳税人纳税。企业所得税上，免税收入跟不征税收入不同，免税收入对应的成本费用可以在计算企业应纳税所得额时扣除，只要总的成本费用大于征税收入，同样可以达到免税的效果。

另外，如果非营利组织符合小型微利企业的认定条件，经营收入也可以享受小型微利企业的优惠。

依据：《增值税一般纳税人登记管理办法》、《增值税暂行条例实施细则》、国税函〔2010〕79号

企业支付给行业协会、地区商会的会费支出，只要支出与企业取得收入有关且合理，就可以税前扣除。而社会团体按财政部门或民政部门规定收取的会费收入，免征增值税、免征企业所得税，可以降低整体的企业所得税。

依据：《企业所得税法》第八条

企业赞助支出、捐赠给个人和没有公益性捐赠税前扣除资格的组织的支出不能税前扣除，但会费支出可以税前扣除。企业支付行业协会商会会费，行业协会商会再根据章程规定开展公益性活动，作为其业务活动成本也可税前扣除。

如果民间非营利组织还取得了公益性捐赠税前扣除资格，则企业、个人捐赠给民间非营利组织的支出都可以在限额内税前扣除。

企业出资给非营利性科研机构、高等学校和政府性自然科学基金用于基础研究的支出，可全额税前扣除并按100%加计扣除。

依据：财政部 税务总局公告2022年第32号

行业协会商会可以依据产销量、企业规模等自主制定会费标准，可以对企业会员、个人会员收取不同档次的会费。企业、员工都成为会员，协会商会依章程开展年度大会、联谊、培训等活动，企业支付会费可以全额税前扣除，协会业务活动成本也可税前扣除。